新源县各类资源富集，产业化发展前景广阔。土壤资源新源县的土壤自西向东、自平原而高山分为河谷平原区和丘陵至高山区。河谷平原区西部多灰钙土，中部多栗钙土，东部多黑钙土；丘陵至高山区(海拔)1000~2000米多为阔叶林土，2000—2800米多为灰褐色森林土，2800米以上多为高山草甸土。在平原和山区的相连部位，分布着山地黑钙土和山地栗钙土。耕作土壤比较好，土壤一般缺磷、多氮、钾丰富。矿产资源主要矿产资源有煤、铁、铜、金、石英、石灰石等，另外还有大理石、铜、钨、冰洲石、重晶石、水晶、方解石等20多个矿种70多个矿产地。其中铁矿石中铁的含量平均为57%，最高达68%，蕴藏量4000万吨以上；石灰石矿蕴藏量10亿吨以上。铁矿、石灰石矿是新源县的优势矿产资源，储量大、品位高，为伊犁州之首。2014年，已开采利用的主要是铁矿石，全年开采铁矿石200.75万吨，比上年下降。

水资源县域内有2条主要河流，3条过境河流，年总径流量十分丰富。地下水资源总储量6.71亿立方米，可采水量3.28亿立方米。

野生动植物主要野生动物鸟类有斑嘴鹈鹕、白鹳、雪鸡、普通松鸡、苍鹰、燕隼等，兽类有雪豹、北山羊、马鹿、棕熊等，被列入国家一类、二类保护的动物25种，其中鸟类18种、兽类7种。

主要野生植物：雪岭云杉、天山桦、欧洲山杨、柽柳、野苹果、野杏等，其中雪岭云杉33481公顷、野苹果树2108公顷、野杏树2708公顷。草(禾)本植物108科687属3270种，有苜蓿、豌豆、雀麦、早熟禾、鸭茅、针茅等。在山川、草地、河滩到处生长着中草药，其中药用价值较高的200余种，如贝母、党参、独活、藁本、甘草、雪莲、麻黄、黄芪等。政区西部有100多平方千米的苇湖，可年产苇20多万吨，鱼类亦很丰富。

农业资源新源县可耕地面积多，日照时间长，水量充沛，土壤肥沃，是伊犁河谷重要的农牧业生产基地。2020年，全县行政区总面积7580.62平方千米，其中：耕地面积856.37平方千米，草场面积4990.67平方千米，林地面积974.41平方千米，森林覆盖率达到15.18%，城市建成区绿化覆盖率40%。水域及水利设施用地面积138.72平方千米，园地面积24.47平方千米，城镇村及工矿用地149.21平方千米，其他土地585.49平方千米。新源县地质条件和成矿背景优越，已发现矿产种类主要有铁、铜、金、钼、锰、铬、煤、菱镁矿、白云岩、硅石、石灰岩、高铝矿物原料等矿产。

新源县已建成国家级重点生态功能区，功能区面积7580平方千米。全年累计建成城市烟尘控制区1个，面积20平方千米；环境噪声达标区1个，面积20平方千米。

林业资源新源县森林资源丰富。1990年，全县有山区天然林经营面积253427公顷，其中林业用地57400.1公顷，活立木总蓄积量1072万立方米。2000年，有平原人工林5404公顷，其中用材林1179公顷、防护林2026公顷、经济林2199公顷，木材总蓄积量96.9万立方米；未成林造林面积179公顷；苗圃面积42公顷；四旁树面积1134公顷；河谷次生林17078.8公顷，木材蓄积量29.7万立方米；野生果树经济林6551.6公顷。全县森林覆盖率13%。在距县城东28千米处的野果林改良场有一块面积为1933公顷的野果林自然保护区，是一片原始状态的野苹果林，塞维氏种占90%.1979年，新源县被列为“三北”（即东北地区西部、华北地区北部和西北地区）防护林体系建设工程重点县。1995年，通过“三北”一期、二期防护林体系建设工程验收1997年，获全国平原绿化达标县称号。2020年，全县完成造林任务406.87公顷，完成任务的101.7%。完成14个村村庄绿化美化建设，绿化面积96.18公顷，国省县道林带实现基本贯通。

畜牧资源新源县是新疆乃至全国的重要畜产品、良种畜生产基地。1979年3月，新源县被定为全国商品牛基地县。1987年11月，又被国家定为全国商品羊基地县和细毛羊改良基地县，2018年11月畜牧兽医站被全国畜牧总站评为全国畜牧（草原）技术推广示范站；20世纪90年代中期起，新源县畜牧业坚持质、量并重，走草原、农区、城郊三位一体的畜牧业发展之路。注重牲畜品种改良，提高良种畜、大畜和生产母畜比重。2019年，牲畜存栏位列伊犁州第一、全疆第二。2020年，全县存栏牲畜共计113.29万头，其中，牛25.95万头，羊77.03万只，马8.03万匹，猪2.20万头，其他0.09万头（只）。家禽81.61万羽。出栏牲畜121.43万头。肉、奶、蛋等主要畜产品年产量分别为5.22万吨、8.79万吨、0.45万吨，分别较2019年增长11.19%、22.63%、25.51%。